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PCR技術專題:直接原位PCR(In situ PCR)

來源:上海北諾生物科技有限公司   2013年11月14日 11:09  

原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。

一、組織切片和細胞樣品的制備

試劑與配置

10%福爾馬林;二甲苯;PBS

操作方法

1. 用10%福爾馬林固定組織8~15hr,石蠟包埋,切片(4μm),將切片置于新鮮的二甲苯中處理5min,放入無水乙醇中浸泡5min,取出,空氣干燥;

2. 對于培養(yǎng)細胞,可直接制備爬片,也可有PBS洗細胞一次,加10%福爾馬林靜置,用橡膠刮下細胞;用PBS洗細胞兩次,2000rpm×3min,用5ml PBS重懸細胞,即可用甩片機甩片或直接吸50μl點在載玻片上。

二、切片預處理(蛋白酶消化)

試劑與配置

0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)

緩沖液A:0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4),0.3% Tween-20,0.5% NP-40

蛋白酶K:20-50μg/ml,溶于TE中

操作方法

1. 干燥后的切片置于0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)中,室溫孵育5min;

2. 浸入緩沖液A中,室溫孵育10min;

3. 滴加20μl蛋白酶K液于標本上,在濕盒中37℃孵育20min;

4. 在室溫下,用0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)漂洗兩次,每次5min。

三、原位擴增(以標記生物素為例)

試劑與配置

PCR反應緩沖液:兩種引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol, Bio-dUTP 50mol,1×PCR緩沖液;

Tag酶:5U/μl

緩沖液B:0.01mol/L PBS,0.1% Triton-X100

指甲油(市售)

無水乙醇

操作方法

1. 切片用1×PCR緩沖液平衡3次,每次5min;

2. 用濾紙吸去切片上多余的液體,置60℃,每片加入30μl PCR反應緩沖液,5U Tag酶,用蓋玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸發(fā);

3. 94℃變性5min,按下列條件(94℃×2min,55℃×2min,72℃×3min)循環(huán)20~25次后,72℃延伸5min;

4. 玻片浸入無水乙醇中10min,以軟化指甲油;

5. 用刀片撬開蓋玻片并除去;

6. 用緩沖液B漂洗兩次,每次3min;

7. 用無水乙醇固定5min,并吹干。

四、檢測(以ABC法為例)

試劑與配置

緩沖液C:0.1mol/L Tris-HCl (pH7.5),0.1mol/LNaCl,2mmol/L MgCl2, 0.5% Triton-X100

封閉液:3%BSA(溶于緩沖液C中)

顯色液:0.05%DAB,溶于0.05mol/L Tris-HCl (pH7.4),臨用前每10ml加30%過氧化氫50μl

1%鹽酸酒精液

蘇木素染色液

操作方法

1. 用30μl 3%BSA滴加在玻片上,封閉1hr;

2. 用緩沖液C簡洗1min,每片滴加ABC復合物20~30μl,室溫放置40min;

3. 緩沖液B室溫漂洗3次,每次15min;

4. 滴加顯色液于玻片上,鏡下觀察控制顯色時間(一般7~14min);

5. 流水洗片,浸入蘇木素液中復染30s,1%鹽酸酒精分化(提抽2次);

6. 常規(guī)脫水、透明、封片,鏡下觀察。

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